拟等位基因（pseudoalleles），表型效应相似，功能密切相关，在染色体上的位置又紧密连锁的基因。它们像是等位基因，实际不是等位基因。一个拟等位基因系列中，各个基因的位置都是邻接着的，它们在功能上又是密切相关的。因此认为它们在生物进化上也具有重要意义。它们可能是由一个原始的基因通过一再扩增并发生突变而形成的。
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